Tout débute lorsqu'Arata touche accidentellement Hermes Apocrypha, le grimoire de Lilith. Cela a pour conséquences de faire apparaître une fille se nommant Lilim et qui considère Arata et Lilith comme ses parents. Pendant ce temps, dans la bibliothèque, est scellé le Seigneur des Démons Blancs. Cette personne complote pour éliminer Arata et les Trinity Seven pour ainsi usurper la position du Seigneur des démons. Possédant une puissance incalculable, le Seigneur des démons blancs attaque Arata et déclenche une crise sans précédant où ce dernier, avec l'aide des Trinity Seven, va devoir le battre pour sauver le monde.

Neo-Tokyo, Japon, 2020. Sahashi Minato, étudiant de 19 ans vient de rater pour la seconde fois son examen d’entrée à l’université. Alors qu’il rentre chez lui, il rencontre Musubi, charmante jeune fille littéralement tombée du ciel. Celle-ci, attaquée par deux autre jeunes femmes aux pouvoirs surnaturels, est à la recherche de son Ashikabi. En effet Musubi est une Sekirei qui veut participer à un tournoi secret organisé par une étrange multinationale, la MBI, où doivent s’affronter 108 Sekirei et leur Ashikabi. Musubi ne pouvait trouver meilleur partenaire que Minato…

Les "Jushikishi" sont des personnes qui peuvent utiliser une capacité nommée "Jushiki". Ils sont capables d'agir sur l'environnement en changeant les lois de la physique. Ils peuvent notamment créer des explosifs, des gaz toxiques mais aussi causer une fusion nucléaire. Nous suivons les aventures de Gayus et de sa partenaire Gigina, deux chasseurs de primes vivants à Eridana. Ils vont rapidement devoir affronter des dragons et vont se retrouver mêlés à des affaires politiques entre plusieurs grandes nations.

Neo-Tokyo, Japon, 2020. Sahashi Minato, étudiant de 19 ans vient de rater pour la seconde fois son examen d’entrée à l’université. Alors qu’il rentre chez lui, il rencontre Musubi, charmante jeune fille littéralement tombée du ciel. Celle-ci, attaquée par deux autre jeunes femmes aux pouvoirs surnaturels, est à la recherche de son Ashikabi. En effet Musubi est une Sekirei qui veut participer à un tournoi secret organisé par une étrange multinationale, la MBI, où doivent s’affronter 108 Sekirei et leur Ashikabi. Musubi ne pouvait trouver meilleur partenaire que Minato…

Étudiant de 20 ans, Minato Sahashi a un très gros manque de confiance en lui et échoue très souvent à l'examen d'entré à l'université ! Mais sa vie banale et ennuyante va vite se terminer quand une Sekirei nommée Musubi tombe du ciel... Elle lui informe qu'il est maintenant son Ashikabi, une personne associé à une Sekirei. Minato devra alors s'associer avec Musubi pour reprendre une vie normale.