Au XVIIIe siècle, alors que l'Église interdit la diffusion de l'Encyclopédie, le philosophe Diderot continue pourtant à l'imprimer clandestinement en cachette dans le château du Baron et de la Baronne d'Holbach. La finition de son travail tarde cependant : quelle définition donner au mot "morale" ? De plus, l'arrivée au château du cardinal et de Mme Therbouche une prétendue artiste venue pour faire un portrait de Diderot n'arrange pas les choses. Le cardinal cependant ne sera pas en reste non plus, dans un château où le vice est préféré aux enseignements religieux ...

Un immeuble paisible à Angoulême. Clémence Lacombe est professeure de piano. Elle reçoit chez elle la visite de son ancienne élève Mona, qu’elle considère comme sa fille, et lui offre l’hospitalité. Un cri dans la nuit, Mona disparaît. Clémence enquête et va soupçonner tout le monde dans son immeuble. Son mari Benjamin, psychiatre, la traite à domicile. La consommation de médicaments de Clémence augmente. Sa raison vacille. Plusieurs éléments la troublent. Est-elle sujette à des hallucinations ? Ou est-elle victime d’une machination qui veut la réduire au silence ?

A Toulouse, en 1761, Marc-Antoine Calas est découvert mort étranglé dans la maison familiale. Son père, le calviniste Jean Calas, injustement accusé de l'avoir tué pour l'empêcher de se convertir au catholicisme, est condamné à mort. Il sera roué, étranglé et brûlé. Voltaire fera de ce "fait divers" un symbole de l'intolérance et du fanatisme...