Wangan Midnight raconte l'histoire d'Akio Asakura, un jeune homme de 18 ans qui s'apprête à finir sa dernière année d'étude au lycée.Comme on le découvre très vite, il est passionné par les voitures, et plus particulièrement par les séries Z de Nissan. On retrouve Akio au volant d'une Nissan 300ZX Z31 accompagné par ses amis. C'est alors qu'ils rencontrent "Black Bird", une Porsche 911 noire dont la réputation semble ne plus être à faire. Akio s'engage dans un défi qui s'avèrera malheureusement perdu d'avance Un flashback nous montre la source de l'attraction d'Akio pour les Nissan Z. Quelques années plus tôt, il avait aperçu une Nissan 240Z (plus couramment appelé Fairlady Z au Japon) a l'intérieur de laquelle se trouvait une jeune fille. Qui de la voiture ou de la jeune fille a le plus attiré l'attention d'Akio ? De retour dans le présent, Akio est averti par l'un de ses amis qu'une Nissan Z vient d'arriver dans la casse de leur ville. A peine a-t-il posé les yeux sur cette voiture qu'il éprouve un choc au fond de lui, comme si la voiture l'appelait. C'est elle, la Devil Z qu'il a toujours cherché, et malgré les avertissements du propriétaire de la casse sur la nature "maudite" de cette voiture, il décide de la prendre.

On suit le quotidien de Tsubaki, une jeune femme qui vient d'entrer dans la compagnie Gandala Music en tant que nouveau manager. Pour son premier pas dans l'industrie, elle va s'occuper de B-PROJECT, une unité composée de trois groupes d'idoles masculines : Kitakore, Thrive et MooNs. Avec tous ces jeunes hommes aux personnalités hautes en couleurs, Tsubaki va devoir faire de gros efforts pour tout maintenir en ordre !

Dans une agence publicitaire (TEN 2) la secrétaire du directeur, Tokine Amino cache aux autres sa nature d’anime otaku. Un beau jour, le directeur va recevoir la visite d’une personne qui se trouve être le représentant d’une célèbre entreprise d’animation. Pour elle pouvoir rencontrer en personne quelqu’un d’aussi important de cette entreprise la remplie d’émotion. Pleine d’entrain, elle prépare la salle de réunion pour le rendez-vous, mais à l’instant où elle s’apprête à sortir, tout se transforme autour d’elle et ne peut plus quitter la pièce. Puis c’est une étrange créature dans un chapeau qui apparaît et lui dit qu’elle ne sera libérée de cet endroit que si elle arrive à résoudre l’énigme.