Shino Asu (Tetsuro Tamba dans un de ses rôles les plus marquants) est un ronin nihiliste, auto-destructeur qui s'abandonne dans l'alcool et les femmes. Après une sanglante rixe avec les forces du shogun, il trouve refuge à Yoshiwara, le quartier des plaisirs de Tokyo. Il fait bientôt la connaissance du clan Bohachi qui régit d'une main de fer la prostitution du quartier. Engagé pour démanteler les bordels clandestins qui nuisent au clan, Asu réalise bien vite qu'il se trouve manipulé et que sa vie ne tient qu'à un fil.

Zatoichi porte secours à une voyageuse en train d’accoucher et qu’un yakuza vient de détrousser. Il sauve le bébé, mais la mère meurt en prononçant le nom du père: “Sataro, à Shiobara”. Zatoichi prend le nourrisson sous sa protection, tandis qu’un mystérieux enfant l’épie, jusqu’à Shiobara où il ne trouve que la sœur de Sataro, Oyaé, harcelée par des yakuzas. Elle attend son frère, d’une province voisine, qui doit apporter l’argent destiné à payer sa dette. Quand Sataro se fait enfin expliquer les circonstances du drame, l’enfant (qui n’est autre que son fils aîné) réapparaît et accuse le masseur aveugle du meurtre de sa mère...