Un an après la défaite de Godzilla aux mains de MechaGodzilla, le Japon répare Kiryu (le nom donné à Mechagodzilla) et s'apprête à reconstruire la ville détruite. Le grand-père d'un des hommes de maintenance du robot est visité par les shojibin, les petites jumelles qui parlent au nom de Mothra, de vieilles connaissances puisqu'il les a rencontrées il y a 43 ans. Elles rappellent que Kiryu est bâti sur le squelette du Godzilla original et que ses os devraient reposer en paix. Si les autorités s'entêtent à utiliser le robot, Mothra ne viendra pas les aider si Godzilla refait surface et pourrait même devenir ennemie de l'humanité.

Les trois Hurricangers, Yousuke Shiina, Nanami Nono et Kouta Bitou, sont occupés à combattre une escouade de Magerappa jusqu'à ce qu'ils soient attaqués par cinq étrangers qui se révèlent être les Gaorangers. Les Hurricangers sont dépassés par la force des Gaorangers et reçoivent l'ordre de leur conseiller, Oboro Hinata, de se retirer dans leur base. Ils sont informés par leur directeur, Mugensai Hinata, que les Gaorangers sont une équipe de héros qui a combattu les orgs il y a un an alors que le trio était encore en formation...